大量新冠病毒的研究產出改變了研究的模式

流行病新冠病毒不斷發展改變，為了趕上病毒的改變成長速度，研究者整理、分析研究的方式也產生了改變(sea change)。

根據Digital Science的執行長Daniel Hook表示，從年初至4月3日為止，Digital Science中已經有超過6,000篇(其中17%的文獻是預印本)關於新冠病毒的研究。新冠病毒的研究文獻成長量之快，與另一新興研究領域AI深度學習的文獻成長速度相較，後者大約需要六年的時間才達到差不多的文獻量。

Daniel Hook表示許多出版社將新冠病毒的研究(包含全文跟數據)「開放取用」，這表示研究者可以用更智慧的搜尋技術，例如文本、資料探勘(text mining, data mining)來取得相關的研究資料，這改變了研究的文化及研究者的工作模式。

英國研究機構The Pirbright Institute的新冠病毒研究小組組長Erica Bickerton表示，研究資料及數據成長快速，但研究社群卻可以快速適應改變、利用這些資料，是整個研究社群互相協助的結果。期刊將新冠病毒相關研究聚集在一起，非營利組織Science Media Centre (SMC) 收集、過濾相關的預印本研究，讓研究者可以快速取用相關的研究。除此之外，在社群平台(例如Twitter)上也有許多有用的討論。

這次科學界快速對新冠病毒做出回應時主要的挑戰之一是快速增加的預印本，預印本是未經過同儕審評的文章，數量快速增加的預印本顯示研究者因為這場抗疫，也在改變他們的想法與研究行為。

開放科學及開放數據如何在對抗新冠肺炎(COVID-19)的戰役中提供協助

在對抗新冠肺炎COVID-19的戰役中，開放科學正在改變科學家的工作模式及合作模式，在各國國境封鎖的狀態下，全世界的科學家透過開放取用的論文、預印本平台及開放數據共享最新研究發現及合作，努力開發COVID-19的疫苗。

*開放科學與開放數據

1. 開放數據

DNA序列(DNA sequencing)是開發特定診斷套組(diagnostic kits)的重要關鍵。上海復旦大學的張永貞教授及其同事首先發現新冠病毒的DNA序列，他們將這個重要的發現放在開放數據儲存庫(open-access data repository) GenBank，全世界的科學家可以立刻開始取用這個發現進行相關研究。截至2020年2月19日，已經有81組不同的新冠病毒基因序列被分享到GenBank上，這為科學家譯解病毒提供有利的資源，並進一步試著找出治療的方法或疫苗。

2. 開放出版品

訂閱期刊論文閱讀很昂貴，作者付費出版讓讀者免費閱讀也很花錢。文中數據指出截至2020年2月18日，在資料庫Dimensions中有500篇與新冠病毒相關的文章，但其中只有32%(160篇)的文章是開放取用(含預印本平台上的文章)，其餘340篇的文章必須要花錢訂閱期刊才能取用閱讀。

但有100間機構與英國慈濟基金會惠康基金會合作，將開放與新冠病毒相關的研究論文和數據，免費取用新冠病毒相關的研究論文及數據可以加速全球研究的速度。

3. 開放教學資源

新冠病毒的爆發使得全球許多學校暫時關閉，轉為線上教學，許多出版社提供免費的開放教學資源或是課程。

*開放科學及開放數據造就科學研究的新景象

在疫情爆發之後，美國科學家招集了全球的科學家在即時通訊平台Slack上共享、討論病毒的相關研究。使用Slack、Twitter等即時通訊平台共享資訊、即時溝通、每天都有大量的資料在預印本平台、開放數據庫上公開共享，這在十年前的科學界是不曾出現過的景象，開放科學及開放數據造就科學研究的新景象。

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How Open Science and Open Data can help in the fight against COVID-19

出版社Emerald及Sage設立補助基金或取消收取APC，協助新冠病毒的相關研究產出盡速出版

學術期刊出版社Emerald設立特別補助基金資助£20,000支付新冠病毒或其他類似的衛生突發病毒相關研究的文章處理費(APC)。

有鑑於新冠病毒的爆發影響全球，Emerald設立特別基金協助與病毒相關的研究能透過出版社的開放取用出版平台Emerald Open Research盡快出版，研究者可以從Emerald的網站獲取更多的相關資訊 (https://www.emeraldpublishing.com/coronavirus/ )。另外，Emerald也加入英國惠康基金會Wellcome Trust的聯合聲明，保證與新冠病毒研究相關的研究發現及數據資料都會迅速公開且分享，協助疫情的防範。

另一間學術出版社Sage也宣布與新冠病毒相關的研究論文，被接受後將不收取APC，Sage也會追蹤這些文章，確保文章能盡快出版。

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Emerald Publishing launches a fund of £20,000 to cover article processing charges, supporting Social Scientists in making their research on health emergencies such as 

Coronavirus (Covid-19) rapidly available

SAGE Waives Article Processing Charges for Research Related to COVID-19

Elsevier與美國大學簽了第一份OA合約

Carnegie Mellon University是一所位於賓州匹茲堡私立國際型研究大學，設有七個學院，約15,000名學生(包含全職、非全職、大學部及研究生) 、1,400名教職員 。

Carnegie Mellon University在2019年年底與Elsevier達成協議，簽成了Elsevier與美國大學第一份Read & Publish協議，這是一份長達四年的合約，於2020年1月開始，Carnegie Mellon的教職員、學生、研究者可以取用Elsevier 的3500本期刊，且無須另外再付費出版OA文章。

Carnegie Mellon University圖書館主任Keith Webster表示：「Elsevier與加州大學系統的談判破裂的經驗替這次的協談成功鋪路，Elsevier在先前談判中的堅持招致了一些批評，但事實上Elsevier似乎已經從一次次的談判中測試跟學習，找到適合的deal模式，從Carnegie Mellon University比較小的機構開始似乎比較能達成協議。」

閱讀原文
Elsevier signs first major open access deal with a US university

美國將強制研究產出開放取用??

2019年年底傳出美國總統川普有意頒布一道行政命令(Executive order)，所有政府資助的研究產出必須公開取用，強制研究產出於出版後可以立即讓大眾可以取用。這與目前美國政策是相當不同的，2013年歐巴馬政府時所制定的政策是公資金贊助的研究產出出版後有一年的延遲期(embargo)，12個月過後得以讓大眾公開取用。這項政策尚未對外正式公布，目前由美國OSTP科技政策辦公室負責，確切內容及進度等詳細內容都尚無從得知，儘管如此，也已在學術出版界掀起一些討論。

若川普的法令發布，則是向歐洲的Plan S倡議靠攏，有助於Open Access及Open Science的發展，一直以來主張開放取用的支持者、出版社非常樂見這項政策的通過，例如加州大學圖書館聯盟(California Digital Library，CDL)、eLife、PLOS、PeerJ等；但出版社反對的聲音似乎多於支持的聲音，超過125家出版社包含ACS、APA、Elsevier、Wiley等商業、學會出版社透過Association of American Publishers (AAP)聯合聲明，聲明中提到政府的強制法令將危害美國產出高品質同儕審評期刊及文章的智慧財產組織(jeopardize the intellectual property of American organizations engaged in the creation of high-quality peer-reviewed journals and research articles)，簡單來說就是一但法令頒布，則出版社會失去營收來源，影響出版社的營運。

摘譯自
Trump could mandate free access to federally funded research papers

Learned societies turn against scholarship and join publishers for profit

A Coalition of 125 Scientific Research and Publishing Organizations Express Opposition to Proposed Policy of Immediate Free Distribution of Peer-Reviewed Journal Articles Reporting on Federally Funded Research

支持者的聲音

延伸閱讀更多資訊

八家出版社將公開其期刊出版成本的細節

cOAlition S在一月稍早提出了期刊出版成本及費用細節的範本，這個範本是由UK Research and Innovation及Wellcome Trust出資贊助，委託調查公司Information Power對資助者、圖書館員、出版社訪談調查後產生的範本，8家不同類型及規模的出版社PLOS、Hindawi、SpringerNature、Annual Reviews、Brill、The Company of Biologists、EMBO Press及European Respiratory Society承諾參與這項實驗計畫，將利用這個範本表格公開其期刊出版成本及費用細節，但內容是有限制的公開，並不會全不對外公開。若這項實驗計畫成功，未來資金資助者或是機構可以利用此範本要求出版社將成本及費用公開透明化。

cOAlition S提出的Plan S要求出版社、出版平台必須將出版成本及費用透明化，這個範本分成三個部分、24個項目，包含期刊基本資訊(APC費用、訂閱費)、期刊品質的評鑑標準(期刊的接收率、每篇文章的引用數)、定價資訊等。這項實驗計畫將持續到三月底。

摘譯自

Eight publishers to volunteer pricing info in pilot study

Eight publishers to reveal details of their cost base in new Plan S pilot

成本及價格範本

OA price and service transparency project